Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms