Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms