Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms