Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP9Q99956 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms