Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms