Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD1Q96JS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms