Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAMP1Q96JM3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms