Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms