Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms