Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms