Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANK1Q8TE04 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PANK1Q8TE04 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PANK1Q8TE04 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms