Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms