Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00301Q8NCQ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms