Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms