Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD53Q8N9V6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms