Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM20Q8N5G0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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