Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNE4Q8N205 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms