Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC103Q8IW40 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms