Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX29P2Q8IUI4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms