Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11FIP4Q86YS3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms