Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D4Q7Z3S7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms