Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf62Q7Z3J2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf62Q7Z3J2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf62Q7Z3J2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms