Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP43Q70EL4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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