Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC141Q6ZP82 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms