Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE3Q6ZMZ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms