Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF6Q6KF10 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms