Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABLIM2Q6H8Q1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms