Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms