Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms