Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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