Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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