Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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