Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIBQ15653 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms