Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRADDQ15628 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms