Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRRQ15256 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms