Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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