Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms