Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD11Q14690 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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