Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERV3-1Q14264 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms