Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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