Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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