Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1A4Q13733 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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