Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms