Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMS2P3Q13401 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms