Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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