Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GRIK3Q13003 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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