Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HMGXB3Q12766 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMGXB3Q12766 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
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