Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PUDPQ08623 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 438 ms