Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms