Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms